Alle Änderungen im Kassenbuch und den Rechnungen sind genau nachverfolgbar, auch mit Datum und Zeit der Änderung, sowie von welchem Nutzer und an welchem Arbeitsplatz diese durchgeführt wurden. Einschränkung hier: mit den benötigten Passwörtern bzw. Zugriffsrechten auf den Server und entsprechendem Wissen über die tomedo-Datenstrukturen, können die Änderungsprotokolle theoretisch manipuliert werden. Hierbei helfen regelmäßige Backups der Datenbank und der Dateien auf externe Medien, da durch solche bewiesen werden kann, dass keine Manipulationen durchgeführt wurden.