Dank Ihrer Hinweise konnte der Fehler inzwischen gefunden werden. Es handelt sich um ein Problem das nur in Kombination mit der aktuellen Impfdoc-Version auftritt. Bis ein entsprechendes Update verfügbar ist, lässt sich der Fehler umgehen indem man im Impfdoc unter "Verwaltung -> Einstellungen -> GDT-Schnittstelle" temporär den Haken "GDT-Schnittstelle aktivieren" setzt, dann unter "Importverzeichnis" den Wert "impfdocxxx" eintippt.
WICHTIG: Anschließend muss der Haken bei "GDT-Schnittstelle aktivieren" wieder entfernt werden!

Es ist ausreichend diese Einstellung nur an einem Impfdoc-Client zu machen, dann sollte auch auf allen anderen Rechnern das Übertragen von Dokumenten wieder fehlerfrei funktionieren.