Sehr geehrter Herr Dr. Raabe,
es tut mir sehr leid, dass Sie dieses Problem haben. Eigentlich ist das von Ihnen geschilderte Verhalten zur Behebeung eines Bugs einer Drittsoftware. Sie können das Verhalten per Hand deaktivieren. Tragen Sie dazu in der Datei ~/tomedo-server/tomedo.properties (Home-Verzeichnis des Benutzers, welcher die tomedoServer.app ausführt):
servertools.reloadAppWindowOnCrash = false
Viele Grüße
Martin Liebeskind